1996年8月创刊，中华医学会主办。本刊原刊名《内镜》杂志。办刊宗旨是：贯彻党和国家的卫生工作方针、政策，注重理论与实际相结合，普及与提高相结合，报道国内外消化内镜学的最新进展，努力推动和促进我国消化内镜技术水平不断提高。《中华消化内镜杂志》主要报道内容包括食管镜、胃镜、十二指肠镜、胆囊镜和大肠镜、小肠镜、乙状结肠镜等领先的科研成果，及其设备、技术在国内外的进展，以及临床诊断和治疗经验等。目前的主要栏目有：论著、短篇论著、基础研究、临床报道、技术交流、特殊病例报道及内镜并发症等。读者对象为从事医疗、教学、科研等工作的消化系疾病及消化内镜工作者。