我国医药卫生行业最高科技奖，中华医学科技奖（2012）颁奖大会于2013年1月27日在北京国家会议中心举行。卫生部党组书记张茅出席并讲话。中国科协常务副主席、书记处第一书记、党组书记陈希，卫生部副部长、中华医学科技奖评审委员会常务副主任委员刘谦，解放军总后卫生部副部长、中华医学科技奖评审委员会副主任委员王玉民，国家科技奖励工作办公室主任邹大挺，武警总队卫生部部长时立强出席大会并为获奖代表颁奖。中华医学会副会长、中华医学科技奖评审委员会执行副主任委员祁国明宣读《中华医学会关于2012年中华医学科技奖获奖项目奖励的决定》，解放军总后卫生部副部长、中华医学科技奖评审委员会副主任委员王玉民主持颁奖大会。
    中华医学会副会长兼秘书长刘雁飞、中华医学会党委书记饶克勤、中华医学会副会长吴明江、祁国明、赵玉沛院士、刘德培院士、李兰娟院士、柯杨副校长、戴建平教授等也出席了颁奖大会。
      2012年中华医学科技奖共有234项科研成果进行申报，经中华医学会审查并组织全国159名中华医学科技奖评审委员会委员评审，依据《中华医学科技奖奖励条例》确立的公开、公正、公平的评审原则，最终评出获奖成果84项及卫生政策奖1人。
    为推动我国医疗卫生体制改革，由卫生部部长、中华医学会会长陈竺同志提议并个人带头捐资，中华医学会设立中华医学科技奖卫生政策奖。首届中华医学科技奖卫生政策奖授予现任中国国际金融有限公司董事长、中央汇金公司副董事长李剑阁同志。奖励他长期以来关注三农问题，尤其是在担任国务院经济体制改革办公室副主任期间，深入调查研究，系统分析我国农村合作医疗保障制度的问题及对策，向党中央、国务院提供了一系列政策建议，为我国新型农村合作医疗制度的建立、实施奠定了坚实的理论与实践基础，是我国研究和制定新型农村合作医疗制度的开创者，为新农合的诞生与发展中所做的突出贡献。
    “经血传播的HIV感染流行特征及其防控措施的建立与研究”等8项科研成果获2012年中华医学科技奖一等奖，“蛋白质组支撑技术及其在重大疾病等研究中的应用”等25项科研成果获2012年中华医学科技奖二等奖，“一些免疫及炎性基因遗传变异对基因功能和肿瘤易感性的作用”等47项科研成果获2012年中华医学科技奖三等奖，“中国艾滋病综合防治实践与对策研究—全国艾滋病综合防治示范区”等2项科研成果获2012年中华医学科技奖卫生管理奖 “包虫病科普手册”等2项科研成果获2012年中华医学科技奖医学科普奖。