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EZH2和microRNA-10 在急性髓系白血病中的相关性分析及对其预后的

2013-10-30 16:52 字体:   打印 收藏 

研究方法
    1.单个核细胞分离:取骨髓液5ml,肝素抗凝,用淋巴细胞分离液分离出单个核细胞,1×PBS洗涤2次,甩干,-80℃冻存。
    2. RNA的提取及逆转录:应用RNA提取试剂盒mirVanaTM miRNA Iso Kit进行单个核细胞RNA的提取,提取过程完全按照试剂盒操作指南进行。本研究所提总RNA A260/A280比值在1.9-2.0之间,RNA纯度好。①取2μgRNA以M-MLV及随机引物进行逆转录反应合成cDNA,作为EZH2基因检测用;②应用Taqman microRNA RT Kit 、microRNA-101及内对照RNU6-1逆转录引物将每例标本的RNA(每个microRNA 应用10ng)逆转录为cDNA,逆转录过程完全按照试剂盒操作指南进行。所得cDNA用灭菌双蒸水按1:10的比例稀释后置于-20℃冰箱冻存备用作为microRNA-101检测用。
    3. MicroRNA的相对定量检测:采用TaqMan探针法进行microRNA-101的相对定量检测。以RNU6-1做为内对照,校正器选用Namalwa 细胞系,反应体系20ul(参照ABI公司MicroRNA表达检测指南)。microRNA-101 的上游引物为 5’-TGGGCTACAGTACTGTGATA-3’ ,下游引物为5’-TGCGTGTCGTGGAGTC-3’. RNU6-1的上游引物为5’GCTTCGGCAGCACATATACTAAAAT-3’,下游引物为5’-CGCTTCACGAATTTGCGTGTCAT-3’;每例标本的目的基因均同时做复孔以减少误差。扩增热循环条件为:95 ℃ 10 min,95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min 。PCR结果采用2-△△Ct法进行分析。
    4. EZH2基因表达的相对定量检测:EZH2(基因编号:2146)基因PCR扩增上游引物5’-GACCCTGACCTCTGTCTTACTT-3’,下游引物5’-GATGGTGCCAGCAATAGATG-3’。对照基因为GAPDH,上游引物5’-TGAAGGTCGGAGTCAACGG-3’,下游引物为5’-CTGGAAGATGGTGATGGGATT-3’。每个反应均设2个复孔,PCR 反应条件为: 95℃5分钟, 95℃,10秒, 56℃ ,20秒 和72℃ ,20秒,共40个循环。
    5.免疫组织化学检测EZH2蛋白表达:采用免疫组织化学SABC法,各步骤按说明书进行,以微波枸橼盐进行抗原修复,DAB显色,同时用PBS代替一抗作为染色的阴性对照,用已知前列腺癌阳性切片作阳性对照.兔抗人EZH2单克隆抗体购于美国Invitrogen公司,DAB显色试剂盒、免疫组织化学染色体试剂盒均购自北京中杉金桥生物技术有限公司。按半定量积分法判定EZH2蛋白表达结果:细胞阳性染色为细胞质内出现黄色、棕黄色、棕褐色颗粒.阳性细胞率:镜下随机选择10个高倍镜视野的1000个肿瘤细胞,计算一个高倍镜视野的阳性细胞的平均百分率,阳性细胞≤25%为0分、26%-50%为1分、51%-75%为2分、>75%为3分;阳性染色强度:无色为0分、黄色为1分、棕黄色为2分、棕褐色为3分.将细胞阳性率和阳性染色强度两者的积分相乘:0分为阴性(-),1和2分为弱阳性(+),3和4分为中度阳性(++),6和9分为强阳性(+++)。